吴秋怡、王芸妮：《“收获导向型”科学家精神教学模式：构成要素、关键机制及改进路径探究》，《高教探索》（CSSCI扩展版来源期刊）2026年第10期。
赖敬茗、钱贵明、吴秋怡、闵超（通讯作者）：《科技资源安全的风险识别与治理：基于情报思维的模型构建》，《情报学报》（CSSCI来源期刊）2026年第4期。
许飞、吴秋怡（通讯作者）：《“主导权”上移：地方政府接续创新的实现路径》，《经济社会体制比较》（CSSCI来源期刊）（录用待刊）。
孟薇、吴秋怡：《以人民为中心推动公共文化服务提质增效》，《新华日报》理论版，2026年2月26日。
龚宏龄、吴秋怡（通讯作者）：《中国式现代化的生态文明道路》，《国家现代化建设研究》（CSSCI扩展版来源期刊）2025年第5期。
龚宏龄、原珂（通讯作者）、吴秋怡：《开卷应考到自洽调适：追赶型城市数字政府建设的解释路径》，《学习与实践》（CSSCI来源期刊）2025年第4期。
吴秋怡、许飞、李永刚：《多措并举优化引资稳资质效 推进高水平对外开放格局》，《新华智库研究》2025年第3期。（入选封面文章）
吴秋怡、刘阮卿：《转变观念，“擦”亮未来————一名“喜憨儿”的父亲、公益项目创始人曹军的口述实录》，《公益》集刊2025年第1辑。
孟薇、吴秋怡、白云腾：《强化国家文化安全教育 坚定文化自信》，《南京日报》理论版，2025年10月15日。
吴秋怡、杨静：《聚焦基层综合执法难题 探索赋能增效创新路径》，《南京日报》理论版，2025年5月7日。
吴秋怡、杨静：《完善基层综合行政执法体制机制 让基层治理更高效》，人民日报《法治参阅》2024年第21期（获得领导批示）。
刘阮卿、吴秋怡：《中国社区慈善研究的发展动态与展望》，《公益》集刊2024年第2辑。
苏雁、葛轩琪、吴秋怡：《凝聚青年力量 呵护悠远文脉——江苏苏州推动非遗技艺传承》，《光明日报》2024年1月第9版。
Wu Qiuyi,“Theoretical evaluation of photovoltaic thermal-water source heat pump, application potential and policy implications: Evidence from Yangtze River Economic Belt, China,” Sustainability（SSCI&SCI来源期刊，JCR：Q2）, 2023, 15(18):13638.
吴秋怡译，翁士洪校译：《英国的规划：新公共管理、网络治理还是后民主》，《治理研究》（CSSCI来源期刊）2018年第1期。
季玉群、邹玲燕、吴秋怡：《文化治理视角下的社区关系与信任构建》，《东南大学学报（哲学社会科学版）》（CSSCI来源期刊）2017年第2期。
谢嘉婷、吴秋怡、翁士洪译：《全球治理的空白地带》，《国外理论动态》（CSSCI来源期刊）2016年第5期。
季玉群、吴秋怡：《信息传播链视角下国产艺术电影的网络营销及其价值提升》，《艺术百家》（CSSCI扩展版来源期刊）2016年第5期。
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